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頰拭子與FTA采血卡的比較
在流行病學(xué)研究中,最常見(jiàn)的是從血液或頰細(xì)胞中收集和分析DNA的方法越來(lái)越普遍。頰樣本無(wú)痛且相對(duì)容易收集,通常是首選來(lái)源。有幾種頰細(xì)胞收集方法:拭子,刷子,漱口水和經(jīng)處理的卡片,例如FTA或樣品卡片。在相似條件下,很少有研究系統(tǒng)地比較頰細(xì)胞收集方法的DNA產(chǎn)量和擴(kuò)增成功率。在122例澳大利亞兒童期急性淋巴細(xì)胞白血病病例對(duì)照研究中比較了頰拭子和FTA卡對(duì)頰DNA的收集和擴(kuò)增。使用實(shí)時(shí)PCR對(duì)頰肌DNA定量檢測(cè)頰肌DNA,并在三個(gè)多態(tài)性的基因座處進(jìn)行基因分型。根據(jù)位點(diǎn)的不同,從口腔拭子抽取的DNA可以成功完成PCR的檢測(cè),分別占62%至89%的受試者和FTA卡的DNA的83%至100%。將FTA采血卡與頰拭子的成功率進(jìn)行比較的匹配對(duì)優(yōu)勢(shì)比(95%置信區(qū)間)如下:使用PCR-RFLP,12.5(11和實(shí)時(shí)PCR,130.0(113.1-152.8)的MTHFR 677C> T); 使用PCR擴(kuò)增的片段長(zhǎng)度多態(tài)性的ACE I / D,3.36(3.2-3.5); XPD 1012G> A使用實(shí)時(shí)PCR 150.0(132.7-172.3)。FTA采血卡是一種可靠的DNA收集方法,通常比頰拭子更可靠地產(chǎn)生適合PCRDNA。但是,在處理FTA采血卡打孔的光盤(pán)時(shí),技術(shù)上存在挑戰(zhàn),有意向的用戶(hù)應(yīng)注意這些問(wèn)題。(《癌癥流行病生物標(biāo)志物》。