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新生兒血卡的全基因組微陣列分析(1)
新鮮血液,從腳跟棒獲得并在紙卡上干燥儲存,已成為50年出生缺陷篩查的標準。這種干燥的血液樣品主要用于分析小分子分析物。最近,這種干血卡的DNA補體已用于靶向基因檢測,例如囊性纖維化中的單核苷酸多態(tài)性。這種測試的擴展包括多基因性狀,或許可能是全基因組掃描,已被討論為正式的可能性。 然而,直到現(xiàn)在,由于DNA回收技術效率低下,從這種干血卡中獲得的DNA量一直受到限制。
結果
采用新技術從標準新生兒血液卡中有效釋放DNA 使用標準新生兒采血卡,收集后平均存儲十年,處理大約1/40的風干新生兒血液樣本(兩個3毫米沖頭)以獲得足夠質量和質量的DNA,直接用于基于微陣列的全基因組掃描。使用相同的DNA釋放技術,還顯示大約1/250 個原始純化的DNA(約1ng)可以進行全基因組擴增,從而產生另外的微克擴增的DNA產物。 然后將擴增的DNA產物用于微陣列分析,并且對初級未擴增的DNA樣品產生99%或更高的統(tǒng)計一致性。
總之,這些數據表明,從Guthrie卡上干燥存放數年的標準新生兒血液標本的不到10%獲得的DNA可以支持全基因組新生兒基因檢測程序。