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采血卡:收集遺傳樣品用于藥物遺傳學(xué)研究的DNA產(chǎn)量和質(zhì)量的決定因素(2)
遺傳和藥物遺傳學(xué)研究涉及不同的中心,信使和實(shí)驗(yàn)室設(shè)備。從血液樣品的高質(zhì)量DNA的收集和分離是這些研究[的第一和最重要的部分。通過靜脈穿刺獲得的血液樣本(標(biāo)準(zhǔn)DNA收集方法)通常由于缺乏資源或經(jīng)過專門訓(xùn)練的人員或文化因素而無法使用。對于大規(guī)模研究,這種方法也可能太昂貴。此外,它是費(fèi)力和侵入性的,并且與潛在的安全問題相關(guān)聯(lián)。樣品必須快速冷凍,液體或冷凍樣品的管理通常會導(dǎo)致高成本。
替代方法基于使用易于收集,運(yùn)輸和儲存的DNA卡的方法是侵入性較小,并且比通常的靜脈穿刺技術(shù)[便宜得多。這些方法使用化學(xué)處理的紙卡,(現(xiàn)在銷售作為FTA洗脫?,Whatman公司,米德爾塞克斯,英國)或FTA標(biāo)準(zhǔn)卡?(Whatman公司)??梢詮倪@些樣品中提取高質(zhì)量的基因組DNA,在DNA庫中提供合適的檔案培養(yǎng)基用于法醫(yī)[或遺傳流行病學(xué)研究。
該DNA采血卡方法已經(jīng)在若干臨床研究被用在例如瘧疾,葡萄球菌,HIV,高雪氏病和癌癥。我們最近使用這種方法進(jìn)行藥物遺傳學(xué)子研究。DNA卡被用來從多中心臨床試驗(yàn)獲得血液樣品,其中響應(yīng)于替加色羅,選擇性5-HT 4受體部分激動劑,是評估腸易激綜合癥患者。
本研究的目的是評估和比較來自兩種不同的DNA采血卡(IsoCode卡獲得的量和DNA的質(zhì)量?或FTA經(jīng)典卡?)和評價(jià)的時(shí)間和儲存溫度的影響,以及存在抗凝血劑,DNA收集。為了確保收集和分離方案的質(zhì)量,通過藥物遺傳學(xué)研究中常用的幾種方法對樣品進(jìn)行基因分型:多重PCR,PCR-限制性片段長度多態(tài)性(RFLP),單核苷酸引物延伸和等位基因鑒別分析。此外,它們通過全基因組擴(kuò)增(WGA)擴(kuò)增以增加基因組DNA質(zhì)量。